这是一个魔法与科技交织的世界，魔法的来历不得而知，总之源远流长，以「罗马正教」为代表的魔法势力长期以来在暗中主导着世界。其他一些强大的魔法势力还包括「英国清教」以及「俄罗斯成教」等，均拥有着强悍的实力。魔法势力长期以来主宰着世界，把握着时代的脉络。但是，这一切都随着学园都市的出现而悄然发生了改变。
超能力，一种不同于魔法的特殊力量随着学园都市而进入人们的视线，拥有着不下于魔法的威力。超能力作为一种不同于魔法的新的力量体系，逐渐登上舞台，隐隐有着与魔法相抗衡的趋势，在冲击着魔法的统治地位。而超能力的研究，正是学园都市的最大特色。
学园都市是由统括理事长亚雷斯塔·克劳利创建的，由「统括理事会」全权管理，拥有着世界上最最尖端的科技，据说领先外界20—30年。
学园占据着日本东京约三分之一的面积，是一个由二十三个学区组成的巨大教育机构的集合体，除了教育机构，还有面向学生的研究设施，生产、商业设施，国际展示场，国际机场等等，总之在都市内生活所必需的各种设施都一应俱全。
学园是一所巨大的学校，致力于发掘和研究超能力，其中的学生则来自世界各地。学园都市中居住着230万人，其中八成以上是学生，学生们学习的内容主要就是开发超能力。
按照超能力的威力可将学生们分为：无能力者（level0）、低能力者（level1）、异能力者（level2）、强能力者（level3）、大能力者（level4）、超能力者（level5）、绝对能力者（level6）6个不同的层次。但是并非所有学生都能够开发出超能力，学园中的学生大约六成为无能力者，并且等级越高人数越少，站在学园顶点的为仅有7个超能力者（level5）。而所谓的level6还只是理论上的概念，并没有人真正触及这一领域。
学园都市的7名level5分别是：
「no.1“矢量操控”一方通行
no.2“未元物质”桓根帝督
no.3“超电磁炮”御坂美琴
no.4“原子崩坏”麦野沈利
no.5“心理掌控”食蜂操祈
no.6未知
no.7“念动力炮”削板军霸」
学园的主体是学生，其他居民主要是教师以及科研人员。学园都市并不存在警察，只有由学生组成的风纪委员（judgi－skill）维护治安。暗地里还有直属学园都市上层的暗部组织，专门处理一些不可见人的勾当，学园并不像表面那么简单。学园都市是一所“光明”与“黑暗”并存的城市。
学园都市内能力者能力的来源分为两种，一种是先天的，即所谓的“原石”。极少数人的能力与生俱来，天生就拥有着特殊的能力。当然这样的“原石”很少，据说全世界不超过50人。而另外一种则是来自后天的开发，学园都市的学生大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。后天能力者依靠自身的计算来使用超能力，计算力越强超能力等级越高。值得注意的是，不论是先天还是后天，每个人所拥有的超能力都只能是一种，并没有多重能力者的存在。
超能力的先天与后天并不意味着“原石”强于后天能力者，事实上，学园都市最强的7人中只有第7位属于“原石”，其他都为后天能力者。当然，神秘的第6人除外，尚未有人知道第六人到底是何方神圣。但即便如此，也能发现“原石”并不优于后天能力者。
学园都市吸收了世界各地的学生，帮助他们开发超能力，汇集了无数的能力者，已然成为了一个谁都不可忽视的强大力量。正因为如此日本才不得不默许这一国中之国的存在，放任其占据着首都东京的一大部分领土。
学院都市代表着一种新的力量体系的崛起，对魔法势力主导的旧有世界格局产生了巨大冲击，隐隐有着「科学侧」与「魔法侧」楚汉争霸的意思。「罗马正教」作为最强大的魔法势力，必然对学园都市产生敌意，策划着一系列针对学园的阴谋；但「英国清教」似乎不满「罗马正教」的正统地位，暗中与学园都市有着若有若无的联系；学园都市的统括理事长亚雷斯塔·克劳利似乎也在进行着某些不可告人的计划……
学园都市，在平静的表面下，暗流涌动。