深坑挖掘完毕后，战俘陆续前往这里，陆战队全部三千名基因人士兵和军官负责深坑内线的防护，其余部队负责外线的防御和戒备，这之间相隔约三千多米。
整整一天时间，战俘才被处理完毕，基因人可以对此无动于衷，在外围的普通士兵或许猜不到发生了什么，但张润农、蒋方震、蔡松坡等人基本能猜到里面发生了什么事情。即使相隔三千多米，还是能听到机枪的嘶吼，甚至能听到战俘绝望的喊叫，他们也痛恨日本人，但还没有到这种******的地步。
如果他们和吕梁一样知晓那段历史，如果他们知晓日本人在旅顺，在南京，在华夏大地做的那些事，也许就能理解吕梁现在的做法了吧！
反游击作战是一个世界难题，有了空军的侦察，陆战队反游击作战取得了不错的成效，消灭了好几只较大的游击队，但九州的游击队反而变得更多。华军遭遇了英军在缅甸的难题，只能重兵保护较大的城市和交通线，保证交通顺畅，另外华军不会一直呆在九州，也就不用费太大的力气保持当地的治安。
相对于陆地上进展的不顺，海军面临的问题要少得多，鹿儿岛港初步修缮后，海军战舰从此出发，沿途打击日本运输船，拦截其他国家的船队，有时候也会对准日本渔船提高一下炮击水平。
华国海军舰队与俄国太平洋舰队进行了分工，俄国负责北海道附近海域，华国负责以南地区。由于水面战舰的不足，海军将潜艇大队调过来，也从鹿儿岛出发，加入封锁舰队的行列。东京等日本重要区域还没有遭受炮击。但九州的战事和严密的封锁让日本人感受到了强烈的战争气氛，本土在严格的压制下还没有出现大规模的骚乱，但物资的匮乏还是让日本人的生活受到极大的影响。
在东京、大阪、名古屋等大城市。各大粮店已经断货，平民想要填饱肚子。就得走出城市到农村寻找粮食。明治天皇号召国民团结一心、共度难关，并要求大家族、大商家拿出储备粮应对危机局面，另外日本政府也拿出部分储备粮供应市场，但对于几千万国民来说杯水车薪。
最令人难堪的是，山县有朋等人作出的决定并没有得到日军东北战区的赞同。统帅东北军队的日本元帅桂太郎（原统帅大山岩元帅死于广州之战）对于恩师的命令放在一边，反而要求东北军队加强防御，绝不后退一步。
桂太郎的决定得到了包括黑木为祯大将等军队上层的支持，他们认为日军经过一年多苦战才获得了战场优势。日本的大陆政策马上就要在他们手里实现，肥沃的土地和丰富的资源等待着日本开发，怎能拱手让给俄国人？
日本绝不谈判、决不妥协，桂太郎代表的陆军上层不顾实际，执意将战争进行到底，为了加快战争进程，俄军在得到了华国物资支援后准备发动一场大规模的夏季战役，彻底打消日军的抵抗意志。
截止到目前，俄军共死伤、被俘27万人，共投入兵力120万人；日军投入兵力109万人。死伤28万人左右。现在的形势是，俄军与日军相持与奉天一线，俄军四十五万人。与日军五十三万人相比人数略少，但物资充足、士气良好。相反日军因为物资匮乏，人数虽多却处于守势，根本无力进攻。
日本满洲军总司令桂太郎元帅，下属第一军黑木为祯大将，拥有近卫师团、第二师团、第十二师团；第二军奥保巩大将（九州之战后返回东北），拥有第一、三、四师团，野战炮兵第一旅团，后备步兵第一、第十一旅团；第三军乃木希典中将（后被儿玉源太郎替换）。下属第一、九、十一师团，后备第一、四旅团。野战炮兵第二旅团，后备工兵队、攻城特种部队（野战重炮兵联队、徒步炮兵三个联队、一个大队）；第四军野津道贯大将。下属第五、十师团，后备三个旅团。另外还有鸭绿江第十师团、后备第一师团等，朝鲜两个师团。总计五十多万人。
沙俄远东陆军总司令李涅维奇制订了第二次奉天会战的计划，从华国得到的一部分火炮、机枪和弹药被加强给了库罗帕特金的满洲第一集团军，作为奉天会战的主力。原陆军大臣库罗帕特金被撤职后担任第一集团军军长，他希望通过此次会战重拾颜面，而现任远东陆军司令李涅维奇本就是他的好友，当然愿意给他这个机会。
1905年7月2日，第二次奉天会战打响，俄军一个军强攻奉天以北的铁岭，充足的弹药让俄军火炮占据绝对优势，日军第一军近卫师团损失惨重，黑木为祯急令第二师团支援铁岭，但俄军攻势强大，近卫师团的弹药很快消耗殆尽，并与俄军展开白刃战，多次打退俄军进攻。关键时刻第二师团的增援及时赶到，稳固了防御。
俄第一集团军利用铁岭战斗吸引日军第一军的注意力，从奉天西北的石佛寺方向发动突然进攻，并短时间内突破日军多道防御线，黑木为祯不得不放弃铁岭，将兵力收缩到奉天周围。奉天危急，桂太郎绝不会放弃这个东北第一大城，立刻命令辽阳奥保巩的第二军前往支援，另外命令儿玉源太郎率领第三军作为后备部队，随时准备支援奉天。
奉天成为一个大漩涡，桂太郎和李涅维奇相继增兵，双方在奉天的兵力很快达到三十万，并持续增加。
库罗帕特金派出以骑兵为主力的攻击集群猛攻奉天左翼，日军第二军奥保巩部从奉天北进，试图挡住俄军