赵翰青正式就任抗日同盟军第一路军总司令。新官上任三把火，他上任之后的第一把火就是开始整编军队。
整军方案是赵翰青早就准备好的，主要涉及到两方面的内容：首先就是取消各个纵队以数字排序的番号，而是改为他方式来命名，比如以地名或山寨的名字为部队的番号，这样容易跟各地多如牛毛的抗日同盟军队伍区分；另外就是举办短期培训班对各个纵队的骨干人员进行军事培训。
当然明面上说是为了提高指战员的综合素质和各个纵队的战斗力，但是，赵翰青还有一个不可告人的目的，那就是通过培训来加强对整个队伍的领导，因为军事培训的同时也可以进行思想教育改造。这是赵翰青从大别山改造抗日同盟军第三路军时得到的经验。
众人一看整军方案并没有影响到他们的权力和利益，以山寨的名义为纵队命名他们自然没有意见，确切地说是很乐意的；至于集中培训大家也没有什么异议，对于赵翰青说的通过培训来提过队伍的战斗力大家也深信不疑，毕竟牛头山队伍的战斗力是大家有目共睹的。
因此，整军方案获得了一至通过。
其实，赵翰青还有另外一套方案，比如逐步实行军事主官互调打破山头主义，健全司令部职能部门等等，但是，这种涉及到私人利益的事情势必会遭到所有人的反对，所以，赵翰青根本没有提。有些事情需要循序渐进，等楚烈那边的的土地改革见到效益施行全军的军饷和物资供应一体化之后一切就水到渠成。
按照整军方案首先确定部队的番号。牛头山的队伍仍旧按照“留取丹心照汗青”来排序。新成立留字营、取字营两个个纵队，再加上之前成立的五个纵队共七个纵队。这七个纵队是赵翰青的嫡系，军事主官也进行了调整。
留字营纵队兵力主要是牛头山预备部队改编而成的，司令李铁锤，留字营负责保卫牛头山根据地，而一直留守根据地的青字营则划归一线作战部队。
取字营纵队司令是陈大年，他已经决定加入抗日同盟军，该纵队是以玉州保安团残部和民壮为基础改编成的，因为不少人经历过玉州保卫战，还有不少人是陈大年的徒子徒孙。因此该纵队具有一定的战斗力。
另外，丹字营纵队司令黑五更，心字营纵队司令聂无双，照字营纵队司令田丰收，汉字营纵队司令黑牛，青字营纵队司令暂时由赵翰青兼任。田丰收的照字营驻守鲤鱼垛，汉字营纵队也归入机动作战部队序列。
原来的牛角峰支队扩编为牛角峰纵队，司令是早已经投靠了牛头山的邓大疤，不过。该纵队的骨干却是出自牛头山军事学校，可以说这个纵队也基本上掌握在赵翰青手里。
孙家寨的寨勇编为孙家寨纵队，司令孙福。不过，另外在赵翰青的支持下又以孙寿的一个支队为基础成立了落雁峰纵队。纵队司令是孙寿，其余的兵员来自牛头山的预备队。
在外人看来孙家寨占了大便宜编成了两个纵队，但是。孙家老大和老二却是苦笑不已，孙家寨名义上是实力大增。实际上是减弱了，因为三弟孙寿跟赵翰青交情最好。这一次升任纵队司令还不对赵翰青更加惟命是从？而且落雁峰纵队的从小队长到支队长大半都是赵翰青的人，用鼻子也能想到这支纵队会听谁的。孙福和孙禄哥俩可真是哑巴吃黄连有苦难言，谁让他们弟妹都胳膊肘往外拐呢？
黑虎军残部编为五垛峰纵队由跟着赵翰青一起南征大别山的袁大头担任司令。
范一统的队伍编为黄石纵队，司令仍旧是范一统。
女子大队升格为女子支队，丁嘉怡和孙璎珞还是正副主官，不过改称司令了。
另外还有六个纵队和七个独立支队，整个抗日同盟军第一路军一共十八个纵队和七个独立支队六万余人，虽然是人数比以前少了不少，但是战斗力肯定大大加强了。
纵队暂定为师一级编制，纵队司令都升为少将。番号和和纵队司令名单确定下来之后由副总参谋长黎明辉报重庆。没多久重庆回电完全同意此次整编，各纵队番号在军事委员会备案，委任状会随后补发，同时还委任赵翰青为抗日同盟军的副总司令，黎明辉为总参谋长。
本来赵翰青兼任了总参谋长，事实上就是抗日同盟军楚烈之下的第二号人物，这一回升任副总司令虽然名义上是升职了，但意义并不大，等于是跟黎明辉腾了一个位置。不过，赵翰青并没有反对，无论是副总司令还是总参谋长都是个虚名，因为抗日同盟军根本就是一盘散沙，打着江湖抗日同盟军旗号的队伍遍布全国各地，无论是副总司令和总参谋长都是有名无实。不过，副总司令名义上好听些。
这时，在上一次叛乱中被烧成废墟的军事学校已经重建完毕了，于是军校的初级培训班正式开课。所谓的初级班招收的自然是各个纵队的中低级军官，随后自然会举办中级培训班和高级培训班。
赵翰青亲自参加了开学典礼，并且还做了讲话，热情洋溢和声情并茂的讲话自然赢得了热烈的掌声。赵翰青从那些参加学习的学员的目光中看到了尊敬，不，确切地说是崇拜，这让他很是得意了一把，崇拜有时候并不是坏事，可以保证自己的绝对权威。
这一次赵翰青只担任军校校长一职，不再客串担任教官，反正校长也可以随时给学员们上课。军校的武术总教官让丁嘉