本来对于广州被围的事件，朱由校在得知后心情已然愤怒至极，他没想到这些西洋番竟如此大胆，为了获得对澳门的控制权竟然不惜挑战自己大明的底线，而围住整个广州城，还杀了几个平民。
朱由校为此甚至已经命兵部左侍郎杨嗣昌开始调集京畿附近的禁卫军和此刻在四川、湖广、南直隶以及京畿一带新招的禁卫军立即齐聚两广，并命北海舰队和东海舰队提前做好应战准备，以应对很可能出现大明不仅仅要与郑氏海盗对战还会与佛郎机进行对战的局面。
朱由校不想在这个时候大动干戈，毕竟这个时候整个帝国的战略资源还没准备充分，禁卫军陆海空(飞行营勉强算空军）三军的扩编还没完成，但现在涉及到大明的主权正在受到威胁，所以朱由校不得不做好破釜沉舟，集全国之力应对外敌入侵的准备。
然而，作为大臣的李明睿和杨嗣昌等人并不认为因为佛郎机人的挑战而表现得如此紧张，作为一个明朝人，李明睿和杨嗣昌没有对佛郎机这样的西洋番并没有什么警惕之心，远远不及他们对鞑子侵掠关内之事的重视，甚至在他们看来这种事件还不如之前发生的民变，毕竟这些都可以导致乱象发生。
而纵观大明乃至于整个华夏历史，还没有南来的外夷的作乱导致了整个中央王朝为之倾覆的历史事件发生。
李明睿和杨嗣昌等官员也就没有从主观上觉得这些西洋番是代表着当今世界先进生产发展方式源头而对这些西洋番有什么畏惧，而作为后世子人的朱由校却深知此时的佛郎机是个什么样的存在，也不得不担心大明会像后世的晚清一样也要经历一个鸦片战争。
尽管朱由校现在已经足够相信自己大明不会像后世的晚清一样沦落为半殖民地半封建国家，但当他得知这些西洋番开始围困自己的广州府城时已经不得不条件性的产生警觉，并担忧会出现自己大明会在短时间内获得较大损失。
杨嗣昌不愿意朱由校这样以调集全国之力的代价来应对一个海外蛮夷，因而在执行任务面前不得不冒着触龙鳞的危险对朱由校谏言道：“陛下，这些佛郎机人不过是从欧罗巴来的一群蛮夷之辈而已，仗着自己船坚利炮就以为自己可以纵横整个海上，还敢挑衅我大明，依照微臣看，不过是夜郎自大而已，要不然他们也不会被一个郑氏海盗挤压，所以，微臣认为此次广州城被围不比大动干戈，出动两广之兵即可。”
“或许正如你所言，我们大可不必如此，但现在朕最担心的却是这些西洋番是不是和郑芝龙等海盗联合了起来，要不然也不敢围我广州城，如此以来，我大明在海疆上面对将不是一个敌人而是一群敌人！”
朱由校说后，李明睿则也站了出来，道：“陛下，无论郑芝龙是否与佛郎机等西洋番联合，他们也只能在海上纵横，即便攻我一二座城池，我大明亦可断其供应，逼其撤离，而且除此之外，诚如嘉靖朝的汪天官所言，我大明只要器物不落于其西洋，则以地利之优势，西洋番夷将难以占我大明半寸之地！”
朱由校不知道是谁给了这些大明官员们这么大的自信，或许对于他们而言，佛郎机的确算不上什么，而李明睿所说的那位汪天官就是在嘉靖朝官至吏部尚书的汪鋐，此人在广东担任海道副使时曾指挥过一次针对抗击佛郎机人侵略的屯门海战并在此战中大获全胜，还顺带把佛郎机的火器引入了大明，使得大明本来开始落后的火器技术再次缩小了与西方的差距，并为日后万历三大征打好了基础。
现在李明睿以汪鋐的话来劝谏朱由校无非就是想告诉朱由校现在的大明无论是火炮还是船体的速度与规模都不亚于佛郎机，因而也就不必担忧佛郎机和郑芝龙联合起来后会对大明形成大的威胁，至少其影响也只能局限在沿海一带，也不可能会让整个大明内地出现动荡。
朱由校也听明白了他的意思，但还是让杨嗣昌继续做好调兵方案，并命李明睿随时在西暖阁待命，至少暂不立即将旨意下达，以等待南边商周祚呈递的最新消息。
就在这时候，外面突然传来一阵紧急的马蹄声，并听其声音高喊道：“大捷！我南海舰队于东沙大败郑芝豹船队，击沉敌舰四十三艘！”
尽管顾三麻子引诱郑芝豹的船队到了东沙才对大败其部，使得郑芝龙和其他海盗势力没有及时得知南海舰队主动对郑氏海盗出击的消息，且因郑芝豹的狼狈出逃而导致郑芝豹完全没有获得半点关于南海舰队与自己发生海战的证据，但作为朝廷官员的顾三麻子在离开东沙时还是主动的命人将这个消息传递给了驻扎在舰队里的锦衣卫。
不过，当锦衣卫提前把顾三麻子打败郑芝豹的这个胜仗以八百里加急的方式不通过锦衣卫北镇抚司和司礼监传递而是直接走中门传给朱由校时，朱由校听后却是半点也高兴不起来，他甚至不由得大怒，直接把手里的笔拍在了案上：
“这个顾三麻子是在做什么！朕不是再三叮嘱过他，不到万不得已不能与擅自与郑氏开启战端吗！如今他竟敢违背朕的意旨，真是狂妄！”
朱由校气呼呼的说后就坐了回来，他不得不承认顾三麻子是一员很善战的海军骁将，但他现在开始怀疑这个顾三麻子是不是有点好大喜功，竟敢罔顾自己的指示而贸然开启战端。
“陛下，常言道，将在外君命有所不受，或