六司则是兵马司、商务司、传驿司、藏库司、匠人司、刑法司。
兵马司主要负责暗杀与情报打探，兼顾谍报人员的培训工作。
商务司负责赚取钱财供应血龙卫的正常运行，兼顾一部分的情报收集。
藏库司是各种资料的储存地，这里有全天下各方势力核心人物的所有详细情报，最是要紧不过，同时兼顾资料分析。
传驿司负责情报传递与命令的下达，另外兼顾新鲜血液的吸收工作。
刑法司主要负责血龙卫的奖惩与审判，兼顾一部分对叛徒的追杀任务。
匠人司则是整个血龙卫的后勤部门，虽然名为匠人司，实际上整个血龙卫从兵器到毒药都是由匠人司所提供，兼顾兵器研发与制造。
六司之间同属一体，并无上下高低之分，但却必须听从三局的命令，不得私自行动。
至于十二衙门就比较好理解了，指的是在大唐十一道分别设置的血龙卫分部，外加一个负责国外情报搜寻的外事衙门，统称为十二衙门。十二衙门下面下辖州府郡县级的分部，拥有相当大的自决权，是血龙卫三大部分中人数最大的一个，但却是地位最低的一个，必须要听从三局和六司的命令。
当然，在这三大支柱之上还有一个主人，以前这个主人是李渊，现在由李贞控制。